Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA1P17302 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA1P17302 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA1P17302 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA1P17302 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA1P17302 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA1P17302 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms