Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ACADSP16219 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ACADSP16219 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms