Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PKHD1P08F94 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PKHD1P08F94 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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