Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSLP07711 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSLP07711 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSLP07711 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTSLP07711 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTSLP07711 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTSLP07711 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms