Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEFMP07197 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms