Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HLA-DQB1P01920 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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