Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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CLDN9O95484 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CLDN9O95484 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLDN9O95484 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLDN9O95484 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CLDN9O95484 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CLDN9O95484 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CLDN9O95484 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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CLDN9O95484 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN9O95484 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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