Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEBLO76041 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
NEBLO76041 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEBLO76041 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEBLO76041 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms