Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PPFIA4O75335 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms