Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HPGDSO60760 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPGDSO60760 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPGDSO60760 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HPGDSO60760 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPGDSO60760 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPGDSO60760 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPGDSO60760 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms