Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCO2O43819 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCO2O43819 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCO2O43819 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCO2O43819 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCO2O43819 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms