Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBDO15205 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBDO15205 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBDO15205 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBDO15205 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBDO15205 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms