Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNMO15061 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNMO15061 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNMO15061 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNMO15061 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNMO15061 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNMO15061 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNMO15061 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNMO15061 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNMO15061 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNMO15061 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNMO15061 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNMO15061 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms