Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms