Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SOBPA7XYQ1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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