Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KNCNA6PVL3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms