Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F8A0AVK6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms