Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms