Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7AQ9UPZ6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms