Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRTO4Q9UKD2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms