Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA9Q9UGM1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms