Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
KDM5BQ9UGL1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5BQ9UGL1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms