Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EXTL2Q9UBQ6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EXTL2Q9UBQ6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms