Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGC1AQ9UBK2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGC1AQ9UBK2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms