Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms