Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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