Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MBD5Q9P267 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD5Q9P267 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms