Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VNN3Q9NY84 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms