Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DLL4Q9NR61 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DLL4Q9NR61 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DLL4Q9NR61 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 461.9 ms