Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MEPEQ9NQ76 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms