Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms