Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms