Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms