Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

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Length 2,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF407Q9C0G0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF407Q9C0G0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF407Q9C0G0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF407Q9C0G0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF407Q9C0G0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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ZNF407Q9C0G0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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ZNF407Q9C0G0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZNF407Q9C0G0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZNF407Q9C0G0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZNF407Q9C0G0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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ZNF407Q9C0G0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF407Q9C0G0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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