Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM54Q9BYV2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM54Q9BYV2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms