Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAPERQ9BY12 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAPERQ9BY12 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms