Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF17Q9BXT8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms