Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms