Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
REPIN1Q9BWE0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms