Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms