Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms