Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms