Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDHD3Q9BSH5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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