Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms