Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3GL3Q99963 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms