Protein–RNA interactions for Protein: Q96SA4

SERINC2, Serine incorporator 2, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC2Q96SA4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms