Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARXQ96QS3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms