Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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C2orf48Q96LS8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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C2orf48Q96LS8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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C2orf48Q96LS8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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C2orf48Q96LS8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf48Q96LS8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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