Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SENP8Q96LD8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms