Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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